Pengendalian Kepala Madrasah dalam meningkatkan mutu pendidikan dengan menerapkan disiplin yang kuat secara bersama sama, mengadakan pengawasan yang melekat secara simultan. Memberikan penghargaan terhadap tenaga pendidik dan kependidikan bagi yang berprestasi serta memberikan teguran terhadap yang melakukan pelanggaran. Kepala Madrasah Aliyah swasta bersama sama meningkatkan empat kompetensi pokok dalam sekolah, kompetensi spiritual, kompetensi sosial, kompetensi ilmu pengetahuan dan kompetensi keterampilan. Strategi kepala madrasah aliyah swasta dalam meningkatkan mutu pendidikan diantaranya adalah meningkatkan kualitas tenaga pendidik dan kependidikan dengan menyeimbangkan jasa yang harus diberikan kepada dewan guru,memfasilitasi kegiatan siswa untuk musabakoh dalam rangka fastabikul khoirot antara pelajar mulai tingkat kota, kabupaten maupun provinsi, mengadakan seleksi ketika penerimaan siswa baru, selalu mengevaluasi kegiatan belajar mengajar dan kegiatan lainnya setiap minggu dan akhir bulan. Bekerja sama dengan wali murid, masyarakat dan lembaga terkait dalam dan luar negeri.